倪挺

發布時間:2021-06-27瀏覽次數:4018

教師基本信息

姓名:倪挺

職稱:教授

職務:院長助理

電子郵箱:tingni@fudan.edu.cn

辦公地點:複旦江灣校區生命科學大樓E601-9

辦公電話:021-31246627


研究方向

細胞衰老及癌變的轉錄組調控


個人簡介

男,1977年出生,博士,研究員,博士生導師。2000年獲北京大學生命科學學院生物化學及分子生物學係學士學位,2000-2006年碩博連讀於北京大學生命科學學院並於2007年獲植物學博士學位。2007-2010年在美國杜克大學基因組科學與政策研究所從事博士後研究。2010-2012年在美國國立衛生研究院(NIH)擔任助理研究員(Research Fellow)2012年受聘為複旦大學生命科學學院研究員。在ScienceNatureNature MethodsGenome ResearchNucleic Acids ResearchAging Cell等雜誌發表研究論文近50篇。目前以細胞衰老及癌變為研究體係,結合高通量測序、分子生物學、細胞生物學和生物信息學等手段研究複雜而多樣化的轉錄組調控,特別是內含子保留和選擇性多聚腺苷酸化這兩種RNA加工成熟過程調控手段的功能、機製及生物學意義。先後主持國家科技部973計劃課題和重點研發計劃課題各1項、國家基金委重大研究計劃培育項目1項及麵上項目3項。


授課情況

參與主講本科生課程《現代生物科學導論》、《基因組學》

參與主講研究生課程《基因組學》、《書報討論(人類生物學)》、《研究生實驗與儀器分析-遺傳模塊》,參與組織和講授《現代生物學基礎與前沿II-遺傳和發育生物學》


招生專業

遺傳學-人類和醫學分子遺傳學、生物信息學-疾病遺傳信息分析


代表性論文和論著

1. Chen, Meng#; Wei, Ran#; Wei, Gang; Xu, Mingqing; Su, Zhixi*; Zhao, Chen*; Ni, Ting*. Systematic evaluation of the effect of polyadenylation signal variants on the expression of disease-associated genes. Genome Research, 2021, DOI: 10.1101/gr.270256.120.

2. Wang, Weixu; Tan, Huanhuan; Sun, Mingwan; Han, Yiqing; Chen, Wei; Qiu, Shengnu; Zheng, Ke*; Wei, Gang*; Ni, Ting*. Independent component analysis based gene co-expression network inference (ICAnet) to decipher functional modules for better single-cell clustering and batch integration. Nucleic Acids Research, 2021, gkab089: DOI: 10.1093/nar/gkab089.

3. Ding, Dong#; Yao, Jun#; Li, Xueping; Shen, Ting; Fu, Haihui; Zhong, Hua; Wei, Gang*; Ni, Ting*. Prevalent intron retention fine-tunes gene expression and contributes to cellular senescence. Aging Cell, 2020, 19(12): e13276.

4. Chen, Meng#; Lyu, Guoliang#; Han, Miao#; Nie, Hongbo#; Shen, Ting; Chen, Wei; Niu, Yichi; Song, Yifan; Li, Xueping; Li, Huan; Chen, Xinyu; Wang, Ziyue; Xia, Zheng; Li, Wei; Tian, Xiao-Li; Ding, Chen; Gu, Jun; Zheng, Yufang; Liu, Xinhua; Hu, Jinfeng; Wei, Gang*; Tao, Wei*; Ni, Ting*. 3' UTR lengthening as a novel mechanism in regulating cellular senescence. Genome Research, 2018, 28(3): 285-294.

5. Ni, Ting#*; Yang, Wenjing#; Han, Miao#; Zhang, Yubo; Shen, Ting; Nie, Hongbo; Zhou, Zhihui; Dai, Yalei; Yang, Yanqin; Liu, Poching; Cui, Kairong; Zeng, Zhouhao; Tian, Yi; Zhou, Bin; Wei, Gang; Zhao, Keji; Peng, Weiqun*; Zhu, Jun*. Global intron retention mediated gene regulation during CD4(+) T cell activation. Nucleic Acids Research, 2016, 44(14): 6817-6829.

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